| Titre : | Integrative analysis of high-dimensional data applied to vaccine research |
| Auteurs : | Boris Hejblum ; Rodolphe Thiébaut, dir. ; Réseau doctoral en santé publique - EHESP ; ED SP2 « Société, politique, santé publique » - Université Victor Ségalen Bordeaux 2 |
| Type de document : | Thèse |
| Année de publication : | 2015 |
| Description : | 172p. / tabl., fig., ann. |
| Langues: | Anglais |
| Classement : | THESE15/ (Thèse soutenue en 2015) |
| Mots-clés : | Evaluation ; Méthode ; Donnée statistique ; Analyse donnée ; Gène ; Grippe ; Vaccin ; VIH ; Biostatistique |
| Résumé : | Les données d’expression génique sont reconnues comme étant de grande dimension, et nécessitant l’emploi de méthodes statistiques adaptées. Mais dans le contexte des essais vaccinaux, d’autres mesures, comme par exemple les mesures de cytométrie en flux, sont également de grande dimension. De plus, ces données sont souvent mesurées de manière longitudinale. Ce travail est bâti sur l’idée que l’utilisation d’un maximum d’information disponible, en modélisant les connaissances a priori ainsi qu’en intégrant l’ensemble des différentes données disponibles, améliore l’inférence et l’interprétabilité des résultats d’analyses statistiques en grande dimension. Tout d’abord, nous présentons une méthode d’analyse par groupe de gènes pour des données d’expression géniques longitudinales. Ensuite, nous décrivons deux analyses intégratives dans deux études vaccinales. La première met en évidence une sous-expression des voies biologiques d’inflammation chez les patients ayant un rebond viral moins élevé à la suite d’un vaccin thérapeutique contre le VIH. La deuxième étude identifie un groupe de gènes lié au métabolisme lipidique dont l’impact sur la réponse à un vaccin contre la grippe semble régulé par la testostérone, et donc lié au sexe. Enfin, nous introduisons un nouveau modèle de mélange de distributions t asymétriques à processus de Dirichlet pour l’identification de populations cellulaires à partir de données de cytométrie en flux disponible notamment dans les essais vaccinaux. En outre, nous proposons une stratégie d’approximation séquentielle de la partition a posteriori dans le cas de mesures répétées. Ainsi, la reconnaissance automatique des populations cellulaires pourrait permettre à la fois une avancée pratique pour le quotidien des immunologistes ainsi qu’une interprétation plus précise des résultats d’expression génique après la prise en compte de l’ensemble des populations cellulaires. (R.A.) |
| Diplôme : | Thèse du réseau doctoral en santé publique animé par l'EHESP |
| Spécialité de la thèse : | Santé Publique - Biostatistique |
| Plan de classement simplifié : | Thèses du réseau doctoral en santé publique animé par l'EHESP |
| En ligne : | http://documentation.ehesp.fr/theses/hejblum.pdf |
Exemplaires (1)
| Code-barres | Cote | Support | Localisation | Section | Disponibilité |
|---|---|---|---|---|---|
| 080981 | THESE15/0002 | Thèse | Rennes | Magasin | Empruntable Disponible |
Documents numériques (1)
 these_Hejblum URL |